动物源性食品鸭血中鸭成分普通PCR检测方法探究

2022-04-08 08:20:31 | 浏览次数:

zoޛ)j馐�< OM4i< C43@<$C4��3@O	E#O~ם~O	D<$O	Eky报告的单位和企业,只能用国家标准进行检测,本文对SN/T 3731.5-2013检测鸭血样品中鸭成分因鸭血DNA部分降解而导致结果偏离进行了方法优化探索,以提高检测结果的准确性。

材料与方法

材料与试剂鸭血:购自南京某大型超市。

DNA提取试剂盒TaKaRa MiniBEST UniversaI GenomicDNA Extraction Kit ver 5.0、TaKaRa Taq(5U/uL)、10×PCRBuffer(Mg2+ pIus)、dNTP Mixture(各2.5mM)、PCR体系预混液Premix EX TaqTM(Probe qPCR)宝生物工程(大连)有限公司。

仪器和设备:EPS 300电泳仪Tanon;UniversaIGenoSensl800凝胶成像仪:上海勤翔;ABI 2720普通PCR仪美国赛默飞PikoREAL 96实时荧光定量PCR仪(96孔板):美国赛默飞。

引物:参照标准合成扩增鸭源性成分的引物,引物序列见标准表1。引物由宝生物工程(大连)有限公司合成。

DNA提取方法:鸭血DNA提取方法按照DNA提取试剂盒的方法步骤进行提取。

普通PCR检测:鸭血中鸭成分检测步骤见SN/T3731.5-2013。

实时荧光定量PCR检测:将鸭血所提DNA进行鸭源性成分的实时荧光定量PCR检测,PCR反应体系为:预混液20ML,包括DNA模板1.6uL,Premix Ex TaqTM(ProbeqPCR)10uL,上下游引物各0.4uL,Probe 0.8uL,加ddH20补足20uL。

鸭成分实时荧光定量PCR反应条件为:95℃预变性30s;PCR反应:95℃ 5s,60℃ 30s,进行40个循环。根据扩增曲线Ct值≤35视为检出鸭成分。

增加模板进行扩增检测:将鸭血DNA添加不同模板量进行扩增,即PCR反应体系中DNA模板分别添加1uL、2uL、5uL、10uL,反应体系和反应条件见SN/T 3731.5-2013。扩增产物进行电泳检测。

二次扩增:将1.7扩增后的产物取2uL加入98uLddH2O进行100倍稀释,取1uL作为模板进行二次扩增,反应体系和反应条件见SN/T 3731.5-2013。扩增产物进行电泳检测。

结果与分析

鸭血样品普通PCR和实时荧光定量PCR检测结果:对提取的鸭血DNA利用鸭源性引物进行PCR扩增,反应产物经琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果,结果见图1。对提取的鸭血DNA利用鸭源性引物进行实时荧光定量PCR,结果见图2。

由图1可知,空白对照和阴性对照无条带产生,阳性对照在226bp有条带产生,鸭血DNA扩增后在226bp位置无可见条带,未检出鸭成分。由图2可知,实时荧光定量PCR检测结果空白对照和阴性对照均为未检出,阳性对照Ct值分别为18.26,检出鸭成分,鸭血两个平行样Ct值分别为23.21/23.95,检出鸭成分。普通PCR与实时荧光定量PCR检测结果不一致,可以推测鸭血中鸭DNA可能受物理、化学等因素的影响,核酸有降解。

增加模板扩增结果:对提取的鸭血DNA添加模板量分别为1uL、2uL、5uL、10uL,利用鸭源性引物进行PCR扩增,反应后取扩增产物,经电泳检测扩增结果,结果见图3。

由图3可以看出,添加鸭血模板量1uL、2uL、5uL、10uL,每个模板梯度各2个平行样,扩增后都是Smear,阳性对照条带正常而且很亮,排除了反应体系及引物的原因。因为鸭血与鸭肉不同,血液的保存期短,储存不了太长时间,基因组降解可能性大。

二次扩增检测结果:由图4可以看出,对鸭血DNA添加不同模板量1uL、2uL、5uL、10uL扩增后的产物,经过1.8步骤进行二次扩增后,空白对照和阴性对照无条带产生,阳性对照在226bD有条带产生,不同模板添加量1uL、2uL、5uL、10uL二次扩增的扩增产物,2uL模板添加量在226bp位置有弱条带,5uL和10uL模板添加量在226bp位置有明亮条带,无非特异性条带,扩增结果良好。

通过增加模板DNA量至5uL后扩增,可以增加目的DNA的含量,通过稀释后,可以降低杂质的含量从而增加目的DNA的含量,提高扩增目的DNA的准确度。目前普通PCR法是国家现有的检测鸭成分的唯一标准方法,是需要出具正式检测报告的检验检测机构的唯一检测方法,而普通PCR法有很大的局限,检测结果不够准确,如果单以SN/T 3731.5-2013方法检测鸭源性成分,可能得到错误的检测结果,因此通过此优化方法来优化检测过程,可以提高检测结果的准确度,可为质检部门及第三方检测机构推广应用,作为实验室检测血液类食品的常规检测手段。

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